《秘密潜入》作为一款特工潜入类游戏的开山鼻祖，充分发挥了游戏的特色，游戏任务多以暗杀，潜伏等为主，通过隐蔽自己，来完成各项任务指标，下面为玩家带来各关卡任务流程。
1 * Trainyard
A 任务 逃逃逃： 误落尘网，夺一老解放逃命。
B 目标 一层半小楼--水塔--了望塔--小院--车库
C 流程 至右方山墙，沿梯上，至对面下梯（小心勿摔），得乌兹，开门，现一爱好艺术的小兵，爆头--这是你开张大吉的时候。另一兵待其冲上时消灭。前进，门口有一按钮，警报若响可按灭，过道左室有电脑，操作后可暂时关闭警报系统。出门至院落，上左方水塔，杀害一兵得狙击枪，狙杀对面了望塔哨兵，沿绳索滑至了望塔（用使用键）。 狙击小院内三名左右巡逻兵，换AK四7，冲梯口一跃而下至屋顶，前行跳下至小院（血如太少，则需下塔绕行翻箱。）冲锋时杀三名左右敌兵，至门外左前方卡车库即可。
2 * SAM base
A 任务 炸炸炸： 炸毁敌三辆SAM导弹发射车
B 目标 弹药库--三辆发射车--直升飞机场
C 流程 杀前方射击掩体中两人及右侧弹药库一巡逻兵（行有余力的话，最好将右前方发射车旁两人一并射杀），右行绕至弹药库两卫兵身后，杀之进门拿弹药，出门至左方导弹发射车旁（此处两人如未杀，须小心。）操作引爆装置，安上感应炸弹后速离（此时不会被爆破）。 其余两辆依此办理，若为保险起见，建议走外侧，即先上山，消灭了望塔上下各一人，上塔后射杀发射车旁卫兵，再行至发射车。最后根据地图指示找到直升飞机场，大摇大摆逛去即可。
3 * Military Airbase
A 任务 鹤翔九霄： 救人未果，险搭性命。（飞机起飞之迅猛，天下第一，注意收看。）
B 目标 雷达站--兵营--塔台--机库
C 流程 前进至雷达站处，消灭内外各一兵，拾枪（不拾白不拾，否则可置之不理），下山至右侧兵营，将冲锋枪放大瞄准，杀门口一兵（此兵有手雷），隔铁丝网杀院内一兵（此兵善良），至门口，消灭卡车左边一兵及岗亭一兵，进入岗亭，操作左墙上开关，打开大门（右为警报，莫触！）。离开后到斜坡下门左，操作开关开门，进入车库。跳上左边平台，杀两巡逻兵。开小门出去，上梯，至另一边出口，开门，干掉院内巡逻兵和水塔上狙击手。贴墙向水塔前进，杀远处巡逻兵和右前方二层楼上一狙击手（耐心）。上水塔得狙击枪，到二层楼旁，杀从左屋处出来的卫兵，再用狙击枪消灭二楼一狙击手和对面大门口两兵。进入二层楼，乘电梯至二楼，补血，得狙击枪。走到院中，至对面铁门处，狙杀院内巡逻兵，速进红色房子。若警报响，速进右边屋子，按墙上按钮关掉，消灭冲入卫兵。
进大厅，杀两兵，从左边门下斜坡，打开另一门后，第一时间杀死门后卫兵。开门，得总部通知，进入左屋补血，回到大厅，从右边门出去，上梯至房顶，从另一端下梯至院子（头晕）。消灭巡逻兵，贴墙前进，杀空地处一卫兵，狙杀对面控制塔上卫兵。进控制塔上梯至塔顶，可见一梯，下到院子，进入对面屋子。穿过几道门，出去往左，至短墙尽头，速出大门，向跑道对面塔台方向前进。在跑道上，速狙杀控制塔顶和岗亭两兵。进入门口岗亭开门，得血，进入身后铁门，进屋后，杀一卫兵，从另一边门口出去，消灭塔台边一卫兵后进入，乘电梯至二楼，上楼梯至塔台顶，操作电脑，取得飞行资料。回到跑道，跑至机库，可见两架战斗机，走至完好的那架，即一飞冲天。
4 * GOD
A任务 杀杀杀：尽可能多地狙杀敌人（最费眼睛、最不费脑子的一关）。
B目标 水塔
C流程 别在前方兵营纠缠，绕行登上山下的水塔，持狙击枪，开望远镜侦察营地，尽量尽快狙杀以红色方框代表的敌人，掩护我方突击队（绿色方框代表）救人，原则是先杀离突击队员近的敌人。一旦突击队员死亡超过三人，任务即告失败。 突击队会冲进红房子，带着Josef出来时，密切注意灰房子。突击队回到直升机即过关。
5 * Rader Base
A 任务 快快快： 关闭雷达等直升机（此关开门次数较多，暴露时间长。）。
B 目标 小楼--雷达站--机场
C 流程 下山至营地，干掉门口卫兵，杀一巡逻兵，进入左侧屋子。乘电梯先到地下室，消灭两人，进一屋里拿血。搭电梯到二楼，干掉两人，至阳台杀一兵，用榴弹轰击了望塔卫兵，尽可能在此多杀死敌人。离开此地进入岗亭，按下按钮，打开左侧铁门，操作电脑，关闭监视器。进刚开的铁门，干掉两边的卫兵。到第三扇门前，按按钮开门进入，先至右边的屋子拿弹药，然后进入左边的屋子，一路冲杀出去，从另一边的门口进入一个院子。
向右进入对面屋子，消灭里面的卫兵。在电脑旁捡一卡（可操纵雷达）。离开后至雷达站，杀门口两卫兵，进去上二楼，操作机器。离开雷达站往左，看到山下有直升机场。绕过山坡，到右侧二层楼后边，爬梯子到屋顶，消灭上边的卫兵，下来干掉一巡逻兵。进入到二楼外边平台，消灭另一卫兵。离开至机场，干掉两个卫兵，静候直升机。
6 * Get Proboi
A 任务 找找找： 找到炸弹后找发电机，关闭后方可翻铁丝网炸油罐，然后寻找关于Proboi的资料。
B 目标 兵营--靶场--机房--油罐--办公室
C 流程 放枪引出三敌人至铁丝网后，逐一消灭，打掉右前方监视器，通过套间进入院落（其间得一火箭筒），杀两哨兵，以集装箱作掩护，击毁装甲车。进入左方露天仓库，抢在一兵按警报前杀之（响则按灭），得火箭筒和手雷。至标有红十字房屋处，打坏监视器，撬门入，第一时间干掉桌旁一人，补血，操作电脑。门后是靶场（此时传来美妙的射击声，勿慌），进入后利用集装箱作掩护，杀死四人，补充大量弹药（卡车内亦有），也可顺便过过瘾。离开靶场，一路杀至左前方机房，消灭飞机旁几人，开门进入，到下面一层关闭发电机。
上机房后的铁塔，狙击下一铁塔上的卫兵，沿绳滑过去，干掉塔下两卫兵，下到地面（直升机内有一兵，你可以很搞笑地穿墙杀之。）。从山坡绕至基地，狙杀了望塔上卫兵，至两个圆柱型油罐后的铁丝网处，翻过去各安一枚感应炸弹于油罐上，迅速翻出狂奔，直到油罐爆炸。回头往基地右边走，到了一间大屋子处再翻过铁丝网，开门进入，内有卫兵。杀后进入一间办公室，再杀一人后搜索文件柜，如果没找到就再杀到二楼，依样办理。
7 * Border Cossing
A 任务 过关斩将： 直升机被击落，这一关又是纯粹的逃命。沿大路一冲到底，见人杀人，见鬼斩鬼！
B 目标 小楼--山坳--兵营--兵营
C 流程 开始行动时一穷二白，除了刀子就剩下了牙。 刺死直升机残骸旁一卫兵，得狙击枪。沿大路靠左行驶（若踏入雪地易被映衬出来），拐弯后狙击窗口一兵，快速冲入此楼，一兵闪出，杀。上楼射杀机枪手，拾枪下楼，小心装甲车（可躲入靠路一边墙角），待其停稳后，透过窗口狙击雪地一卫兵及右侧血站一兵。出门消灭路对面雪地一兵，小心至大路，杀前方小楼一狙击手，补血、拾枪，一路前进。发现一废墟处两卫兵，鸡肋耳，不妨大度些。沿路左侧雪地前进（勿越界，否则触雷。），见一兵营，有5兵，不忙收拾。此时直升机已被引出至这侧，快速冲向路对面山坳（此处无雷，乃唯一避难所。），和它绕圈--别和它在同一片灰天下，即可。装甲车此时亦可能出动，依旧是鸵鸟政策。
确认它们下班后，回大路，狙击兵营5兵。前进，切切消灭路左警报器旁一卫兵，否则装甲发动。此屋内外各有一人，杀后补血。沿路至下一个兵营，在树后狙击路左营区的一巡逻兵和楼上一兵（右侧可不管）。顺时针走，从卡车边铁丝网翻入，见一直升机，顺时针绕其周围矮墙慢慢前进。见岗亭，快速冲入，操作电脑及按钮，大门訇然中开。出大门，至路边卡车，过关。