主线任务
前往Korlus雇佣Dr. Okeer（TheWarlord）
Korlus星球是一个垃圾场，同时也是佣兵和Korgan驻扎的地方
Okeer一直想要把Korgan从Genophage中拯救出来，为此，Cerberus相信他联系过Cellocters想取得他们的技术。他对Collectors的了解对对抗Collectors很重要
刚着陆，就听见有个女人在广播中给佣兵下命令，看来这里正有一场冲突。
从这个受伤的佣兵了解到Okeer正在和一个叫Jedore的佣兵头目合作，帮她建造一个Korgan军队。但是看起来Okeer在实验室里制造的Korgan不是非常成功。
前进途中看到一个Korgan在和几个Blue Suns佣兵交战，解决完佣兵和和那个Korgan谈话。得知他是在实验室的培养罐里出生成长的（一路上看到的Korgan尸体都是），现在只有7天大。Jedore想要把他们训练成自己的军队，显然Korgan不听她的话。Okeer制造了这些Korgan，但是和他们说你们不是完美的，就把他们从培养罐里放出来了。同时得知Okeer不想找到治疗Genophage的方法。
继续前进，在实验室里找到Dr. Okeer
原来，Okeer并不寻求治愈Genophage，他想制造的是一个完美的Korgan战士，带有Genophage，但是不受Genophage的影响而削弱。之前遇到的Korgan都是他制造出来的不完美的。
他给了Collectors很多制造出来的Korgan，以交换他们的技术。而他把这个技术用在了这里的原型上，以制造出完美的Korgan
谈话途中，Jedore在下面指挥部队，准备摧毁Okeer的原型。Okeer让Shepard去阻止她。
战斗时注意从两边冲上来的的Korgan
解决敌人后，DEI说Okeer在实验室做了些什么，实验室现在充满毒气，Okeer的生命指标正在急速下降。于是Shepard赶回实验室。
回到实验室，发现Okeer已经死了。墙上播放着他录制的遗言：你给了我时间，Shepard，如果我知道Collectors在攻击人类殖民地的话我一定会告诉你的。我的一切都倾注在这个原型上了。这个原型是完美的。在这里按空格。
Shepard呼叫Normandy把Okeer的原型运回船上。
简报室里，Miranda反对打开培养罐，但是尊重Shepard的意见。
来到飞船底层，原来锁着的Port Cargo现在可以进入了，进去把Korgan释放出来。
Korgan果然好战，刚一出来他就把Shepard按在了墙上。
他自己给自己命名为Grunt，Shepard给了他一个为主角战斗的理由，告诉他Collectors是值得战斗的敌人。Grunt决定暂时为Shepard战斗。主线任务结束。
本星云的支线任务
到Amun星系的Neith上，EDI会提示有异常信号，找到后发现这里有货船坠毁，发现有东西在移动，但没有发现有机生命体。
着陆后，在这里找到飞船报告（黑匣子），读报告后发现飞船坠毁前护盾完好、生命支持系统完好，但是其他功能遭到极大损坏。
一直向前走，途中会找到各种报告，得知坠毁前发现货物舱的机器人自动开启了，并且开始自爆。到最前面把Distress Sigal关闭后，Shuttle（降落用的飞船）会提示有敌意的机器人正在向这里过来，而且沙暴也在逼近，要撤退回Shuttle。
往回跑，这里机器人应该是无限刷的。时间越长因为沙暴的原因能见度越低。回到Shuttle就完成任务了。
回到Normandy，EDI给Shepard发了邮件，它找到了坠毁飞船最后的停靠地点——Strabo星系的Jarrahe空间站。Shepard决定去那里调查机器人暴走的原因。
到达空间站后，发现空间站里的人都被杀了
从一具尸体上的PDA中得知，很可能是空间站的VI把人都杀了的。空间站的人为了处理这一事件把除了生命维持系统以外的电力都关掉了。
名词解释：
VI：Virtual Inteligence 的缩写，虚拟智能。与AI不同，VI不会自我进化，也没有自我意识。AI被议会禁止后，VI技术迅速发展。
继续向前走，打开门后，VI在广播中警告入侵者（Shepard）。在另一个PDA上了解到，VI很有可能发生故障，认为空间站被病毒感染了。
进入左边的实验室，打开电源
来到电脑前，四台电脑分别控制下面四个反射镜的位置。调整位置，让激光折射后击中最前面中间的蓝色容器。
回去，再从右边的门进入，恢复电力后，VI说居住区已被隔离，建议入侵者启动自动销毁程序以免自己饿死。。。此时门锁上了。在下图的地方，先使用中间电脑，再使用右边的，门就开启了。
原来关闭的门现在也开了，里面有点钱。
回去，从正前方的门进入引擎室，注意躲避蒸汽。从一个人的PDA上了解到，他认为VI的不正常举动是在那艘货船来之后才产生的。
恢复引擎室电力。
回去，恢复中间房间的电力就可以进入主机了。Shepard关闭VI，回Normandy。
EDI又给Shepard发了一个邮件，说已经追踪到VI病毒的来源了，在Capek星球。（解锁Titan星云）
来到Capek，经过扫描显示，机器人工厂已经没有生命存在，被病毒感染的机器人占据工厂，Shepard需要关闭生产。
工厂里敌人很多，注意弹药。工厂里还有不少Element Zero。
关闭生产线后，任务结束，整个支线任务也就结束了。。。好长的支线。。。