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现有传染病和流行病两个省医学重点学科,承担一批重大科技攻关项目和自然科学基金项目,先后获得国家级科技进步奖3项,省部级科技进步奖70余项。同时,与WHO、联合国儿童基金会、美国CDC、日本JICA等20多个国际组织、国外机构和学术团体建立了合作关系。编辑出版的《河南预防医学杂志》发行全国。
拥有高效液相色谱仪、液相色谱质谱联用仪等大批国际领先的卫生检验检测仪器设备,其中万元以上设备870台件,总价值约1.1亿元。实验室建设和管理规范,拥有26个BSL-2实验室、2个全省独有的BSL-3实验室、省A级SPF实验动物室和生物资源库。2004年,卫生检测检验中心获得国家实验室认可证书和计量认证合格证书,认可项目达到636项,并被商务部第一批授予“全国食品安全检测机构”称号。艾滋病确认、脊灰监测、麻疹监测等实验室均通过WHO或卫生部认证。
河南省疾病预防控制中心经历了抗击非典和预防控制艾滋病、人感染高致病性禽流感等重大传染病,以及救灾防病和抗震救灾的洗礼,经受了严峻的考验,先后被卫生部和人事部授予“全国卫生系统先进集体”,被河南省委、省政府授予“文明单位”和“抗击非典先进集体”,被河南省总工会授予“‘五一’劳动奖状”。2011年,中心被国家文明委授予“全国文明单位”荣誉称号。
2011年12月,获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第三批全国文明单位”荣誉称号。
2020年4月,入选河南省新冠肺炎疫情防控应急科普工作先进集体名单。
2022年4月28日,荣获2022年全国五一劳动奖状。
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